花蓮的雨很多，大部分集中在 9 月至 11 月（請看最佳旅遊季節）。大雨過後，太魯閣很多步道會關閉好幾天，賞鯨船會停航，山路也最好避開。這個行程都在市區和 310 公車沿線附近。
颱風天另當別論：發布颱風警報時，請待在原地。火車可能停駛，台8線和蘇花公路會封閉，景點也會關閉。出發前請先查看天氣和臺鐵的消息。→ 火車與颱風
上午：室內的太魯閣
太魯閣遊客中心是峽谷一帶最適合下雨天的地方。展館介紹太魯閣的地景、生態和太魯閣族的歷史，還有一間適合 5 至 12 歲的互動兒童展館。簡報室輪流播放兩部短片，其中一部是關於 2024 年地震後的國家公園，場次是 09:30、10:30、11:30、13:30、14:30 和 15:30。開放時間 08:30 至 17:00，每月第二個星期一休館；可以搭台灣好行 310 或計程車前往。
中午：石雕、海水和午餐
- 花蓮縣石雕博物館，搭 310 回程時順路：大理石和石材雕刻，大部分在室內。星期二至星期日 09:00 至 17:00，NT$20。
- 台肥花蓮深層海水園區，也是 310 的停靠站：修復過的日治時期廠房，還有一間展覽館介紹深層海水是怎麼抽取上來的。開放時間 09:00 至 17:00。戶外的泡腳步道下雨時很滑。
- 到市區吃午餐：扁食和小籠包，正適合下雨天。→ 花蓮必吃
下午：有屋頂的市區
- 松園別館，看展覽館，在松林間的咖啡館坐坐。每月第二個星期二休館。
- 市區的鐵道文化園區（星期一和星期二休館）和文化創意產業園區。→ 花蓮市
- 花蓮美術館，就在石雕博物館旁邊，星期二至星期日開放。
晚上
東大門夜市是露天的，但很多攤位都有遮雨棚，小雨很少讓它停擺。如果是傾盆大雨，就改在市區吃。
小提醒：這裡很多博物館星期一休館（石雕博物館和美術館），或星期一和星期二休館（鐵道文化園區）。遇到這幾天，就以太魯閣遊客中心、松園別館和深層海水園區為主。
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資料來源：太魯閣國家公園，遊客中心；石雕博物館；花蓮觀光，台肥深層海水園區；台灣好行 310 太魯閣線；文化局，松園別館；文化局，鐵道文化園區；花蓮美術館。2026 年 10 月查核。